繼續(xù)教育學(xué)院是福建衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院開展學(xué)歷提升與教育培訓(xùn)的職能部門，原隸屬學(xué)院教務(wù)處。2013年，學(xué)校機構(gòu)調(diào)整，將成人函授教育管理從教務(wù)處獨立，設(shè)立成人教育中心；2016年，成人教育中心更名為繼續(xù)教育中心，設(shè)立函授科和培訓(xùn)科；2020年11月，繼續(xù)教育中心更名為繼續(xù)教育學(xué)院；2022年5月，增設(shè)學(xué)籍管理科和技能鑒定科。繼續(xù)教育學(xué)院作為學(xué)校主動服務(wù)區(qū)域經(jīng)濟發(fā)展，開展高等學(xué)歷繼續(xù)教育和教育培訓(xùn)服務(wù)的主要部門。
學(xué)校高等學(xué)歷繼續(xù)教育起步早，自20世紀80年代開始，與中國藥科大學(xué)合作成立中國藥科大學(xué)成人教育福建函授站，開展藥學(xué)專升本、中藥學(xué)專升本、藥學(xué)?？瞥扇烁叩冉逃ぷ?。2001年，經(jīng)省衛(wèi)生廳、省教育廳備案，學(xué)校創(chuàng)建北京中醫(yī)藥大學(xué)遠程教育學(xué)院福建衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)習(xí)中心，面向我省社會各界招收護理、中藥學(xué)專業(yè)本?？茖W(xué)生。2008年，學(xué)校開辦護理、醫(yī)學(xué)檢驗技術(shù)高職函授專業(yè)；2009年，增設(shè)臨床醫(yī)學(xué)、助產(chǎn)、醫(yī)學(xué)影像專業(yè)；2014年，增設(shè)中藥學(xué)函授專業(yè)。2014年，學(xué)校與福建醫(yī)科大學(xué)、福建農(nóng)林大學(xué)、福建中醫(yī)藥大學(xué)聯(lián)辦專科與本科銜接自學(xué)考試助學(xué)班，招收護理、藥學(xué)、中藥學(xué)專業(yè)學(xué)生。2016年，與福建中醫(yī)藥大學(xué)聯(lián)合招收護理專升本函授。2017年，經(jīng)福建省教育廳備案，學(xué)校在福建閩北衛(wèi)生學(xué)校設(shè)立成人高等教育校外教學(xué)點。
學(xué)校主動服務(wù)區(qū)域經(jīng)濟社會發(fā)展，開展教育培訓(xùn)服務(wù)。牽頭成立福建省基層衛(wèi)生技術(shù)人員培訓(xùn)集團（常務(wù)理事單位37個，理事單位100個），設(shè)有福建省基層衛(wèi)生技術(shù)人員培訓(xùn)基地、鄉(xiāng)鎮(zhèn)衛(wèi)生技術(shù)人員培訓(xùn)中心和鄉(xiāng)村醫(yī)生培訓(xùn)中心，獲批福建省公務(wù)員培訓(xùn)基地、福建省農(nóng)民工“求學(xué)圓夢行動”項目培養(yǎng)高校和培養(yǎng)基地、福建省繼續(xù)教育示范教學(xué)站點培育項目單位、福建省社區(qū)示范教育基地、全國護士資格考試試題開發(fā)基地、福建省醫(yī)療護理員培訓(xùn)中心、福建省藥師協(xié)會執(zhí)業(yè)藥師繼續(xù)教育面授施教機構(gòu)、福州市長期護理保險評估機構(gòu)、全國營養(yǎng)指導(dǎo)能力提升備案機構(gòu)、福建省人力資源和社會保障廳“揭榜掛帥”培訓(xùn)單位。面向基層開展鄉(xiāng)村醫(yī)生規(guī)范培訓(xùn)、醫(yī)藥衛(wèi)生技術(shù)人員培訓(xùn)等項目；面向企業(yè)職工和社區(qū)開展護理急救、健康養(yǎng)生等技術(shù)培訓(xùn)，年培訓(xùn)約3萬人次。2017年，校本部被評為福建省教育廳繼續(xù)教育示范教學(xué)點。2018年學(xué)校被教育廳評為“社區(qū)教育示范基地”，獲得全國“優(yōu)秀成人繼續(xù)教育院校（培訓(xùn)學(xué)校）”。2020年，學(xué)校老年項目獲福建省高校老年大學(xué)建設(shè)項目。2022年中國藥科大學(xué)福建衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院函授站獲“高校繼續(xù)教育優(yōu)秀校外教學(xué)點（函授站）”
福建衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院職業(yè)技能鑒定站始建于2002年11月，是福建省人力資源和社會保障廳批準的省級職業(yè)技能鑒定站。站長由學(xué)校校長兼任，副站長由分管教學(xué)的學(xué)校副校長兼任。鑒定站具有良好的工種培訓(xùn)與鑒定條件，有一支穩(wěn)定的高素質(zhì)教師隊伍和管理人員隊伍。目前開設(shè)有育嬰員、養(yǎng)老護理員、保健按摩師、美容師、芳香保健師、醫(yī)藥商品購銷員、老年人能力評估師、保育師、社群健康助理員、電工、醫(yī)療護理員(護工)、孤殘兒童護理員、健身教練等工種的鑒定考核及“1+X證書”制度試點工作。2019年獲批福建省衛(wèi)生健康行業(yè)職業(yè)技能鑒定站；2021年獲批福建省職業(yè)技能等級認定機構(gòu)；2022年獲批全國計算機等級考試考點。獲國家職業(yè)教育1+X證書《失智老年人照護》職業(yè)技能等級證書培訓(xùn)考核工作“2022年度試點工作示范院校”榮譽稱號。2023年入圍重點產(chǎn)業(yè)項目“揭榜掛帥”培訓(xùn)單位，其中育嬰員工種入圍嬰幼兒照護人才培訓(xùn)項目；養(yǎng)老護理員、健康管理師工種入圍康養(yǎng)服務(wù)人才培訓(xùn)項目。榮獲第一批福建省職業(yè)技能等級統(tǒng)一認定報名示范點單位。2023年，入選中國健康管理協(xié)會營養(yǎng)指導(dǎo)能力提升備案培訓(xùn)機構(gòu)。2024年，入選福州市新職業(yè)工種和未就業(yè)重點群體職業(yè)技能培訓(xùn)機構(gòu)。2025年，學(xué)校獲批健康照護師職業(yè)技能等級認定資質(zhì)，入選福州市閩侯地區(qū)唯一一個“一縣一品”勞務(wù)品牌單位，獲批福建省醫(yī)保局遴選備案的長期照護師職業(yè)技能等級認定機構(gòu)。
30多年來，福建衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院繼續(xù)教育學(xué)院依托學(xué)校良好辦學(xué)條件和雄厚的師資力量，堅持“為行業(yè)培養(yǎng)人才，為社會健康服務(wù)”的辦學(xué)宗旨，大力開展成人高等教育、自學(xué)考試、繼續(xù)教育培訓(xùn)、職業(yè)技能培訓(xùn)鑒定等，形成了多學(xué)科、多層次、多形式的辦學(xué)格局。